談到日本的軌道交通，主要分類有：JR、私鐵、地鐵、新幹線。
JR，即Japan Railways，在以前統稱為「日本國有鐵路」。後來按照不同區域或功能，分為不同的幾家公司：「JR北海道」、「JR東日本」、「JR東海」、「JR西日本」、「JR四國」、「JR九州」和「JR貨物」。嚴格來說，日本新幹線（即日本的高鐵）也根據區域被所在地的JR企業管理，不過因為新幹線的歷史背景和速度上的差別，新幹線沒有被視為JR的一部分。
JR在「國鐵時代」擔負著長途客運及城市和郊區通勤客運兩大功能。後來日本修建了更加便於長途客運的新幹線，JR的功能就只剩下後者。就像是在台灣，JR就類似「台鐵」，台灣高鐵在西部沿線加速了交通的疏運，台鐵就漸漸地轉型成都會區的聯絡交通工具。
在城市近郊，為了加強運輸效率，JR有快車和慢車兩種方式。由於東京首都圈（也就是一般所稱的一都三縣，含東京都、千葉縣、埼玉縣及神奈川縣）面積不大，但卻有著近4000萬人口，站與站之間的距離比較短，最短的站間距離甚至不到500米，所以設計了「快車」這種方式，只在比較大的站或轉線站停靠。
日本的私鐵，便是私有企業修建的鐵路。為了盈利需要，私有企業一般不會在中小城市修建鐵路，所以日本只有幾個大城市才有私鐵，主要集中在東京和大阪。東京都市圈有「東急」、「京急」、「京成」、「東武」、「小田急」～～等，一般以東京為中心呈放射狀連接郊區和其他衛星城市 ; 以大阪為中心的關西都市圈有「近鐵」、「阪急」、「阪神」、「京阪」、「南海」～～等。大型的私鐵企業可以有多條線路，甚至自成交通網絡，小的私鐵有的只有一條線路。
談到日本的私鐵，又可分類為大手私鐵、準大手私鐵、中小私鐵三種。今天要特別與大家談到的是「大手私鐵」（中文直譯：「大型民營鐵路業者」），又名「大手民鐵」。「大手私鐵」公司集中在東京、大阪、名古屋、福岡這四大都市圈。
2004年，原為公營的「帝都高速度交通營團」（簡稱「營團」）民營化成為東京地下鐵（東京メトロ），也正式加入「大手私鐵」行列，至目前為止，日本民營鐵道協會的記錄中，全日本共有16家「大手私鐵」。
「大手私鐵」一覽表
＠關東地方（東京‧橫濱大都會區）
* 東武鐵道（東武） * 西武鐵道（西武） * 京成電鐵（京成） * 京王電鐵（京王） * 小田急電鐵（小田急） * 東京急行電鐵（東急） * 京濱急行電鐵（京急） * 東京地下鐵（東京メトロ） * 相模鐵道（相鐵）
＠中部地方（名古屋大都會區）
* 名古屋鐵道（名鐵） * 近畿日本鐵道（近鐵）- 部分路線在三重縣和愛知縣 * ＠近畿地方（京都‧大阪‧神戶大都會區）
* 近畿日本鐵道（近鐵）- 目前日本規模最大的私鐵業者
* 南海電氣鐵道（南海）- 純民營，為日本歷史最悠久的私鐵業者 * 京阪電氣鐵道（京阪） * 阪急電鐵（阪急） - 阪急阪神控股集團 * 阪神電氣鐵道（阪神） - 阪急阪神控股集團
＠九州地方（北九州‧福岡大都會區）
* 西日本鐵道（西鐵）
從上述的這些「大手私鐵」公司來看，東京都的交通整合看似比關西近畿地區來得完整，雖然東京都的私鐵公司眾多，但是在都會區中大多仍以「JR」、「都營地鐵」與「東京Metro」為主，這幾年東京交通局與東京Metro公司合作推出的「Subway Ticket」優惠券更是讓前往東京都旅遊的旅客更為便利運用。
東京是亞洲最早擁有地鐵的城市，早在1927年12月就已經開通了第一條地鐵線路。東京的地鐵包括兩部分：「東京Metro」（日文是東京メトロ，字面上是東京地鐵的意思，但這只是東京地鐵的一部分）和（東京）「都營地下鐵」。
根據日本國土交通省2012年度的調查，在東京，每天使用地鐵或電車的人數達到3783萬人次。從不同線路來看，近1600萬人乘坐JR東日本，約900萬人乘坐地鐵（其中包含乘坐東京Metro及東京都營地下鐵），300萬人乘坐「東急線」，250萬人乘坐「東武線」、200萬人乘坐「小田急線」，170萬人乘坐「京王線」。其他還有「西武線」、「京成線」、「京急線」、「相模鐵道線」等。
在東京每天使用地鐵或電車的人數達到3783萬人次，其中有2300萬人次使用了「定期券」。這對於兩點一線上班族和學生來說，是一種非常便利和優惠的車票。還有另外一種使用非常普遍的車票～～「回數券」，回數券的樣式、有效期和折扣比率都不一樣，有效期大多數有三個月。除此以外，還有一種「一日乘車票」，600日元，在當日可以任意乘坐。東京Metro的「一日乘車券」在2016年3月26日改為「24小時券」。票價依然是600日元。修改後的好處便是更優惠、更有彈性。針對外國觀光客或是外地到東京旅遊的本國觀光客，由東京都交通局與東京Metro公司共同推出的「Subway Ticket」24、48、72小時券，在限定時間內可以搭乘都營地鐵4條路線及東京Metro地鐵9條地鐵，更是經濟實惠又划算。
在東京，最常用的兩種乘車卡是Sucia和PASMO。Sucia卡是2001年由JR東日本發行，PASMO卡則由關東地區的私鐵和地鐵聯合發行。2007年3月18日起，Susia和PASMO兩卡進行了整合。整合後的Sucia和PASMO卡可以用來乘坐東京首都圈的幾乎所有列車，包括JR、私鐵和地鐵，但不包括新幹線。這兩種卡在東京車站的自動售票處、售票窗口或鐵道公司站台都能買到。購買時，預付500日元（退卡時退款）和自己選擇的充值金額。
日本的城市交通運輸效率享譽全球，特別是東京。前往東京自助旅行，善用這些軌道交通當成交通聯絡是非常便利的，儘管東京軌道系統一共有80多條線路，東京交通線路圖就像迷宮一樣，這麼一個令人眼花撩亂的交通網絡卻每天都井然有序高效率地運行著，這樣的結果只因為日本政府早年預見性的規劃。藉由通過提高牌照稅、燃油稅和保險費、停車費、高速公路費～～等手段，控制汽車數量，形成了如今大城市主要以大容量軌道交通為主的運輸網絡。
東京軌道交通的複雜和人性化管理的細節，僅看文字介紹應該還是感覺很混亂，或許只有親自體驗一段時間才能更加了解。後續將針對東京的這些軌道交通、大手私鐵逐一做介紹，方便夥伴們前往東京自助旅行時，能更加清楚明白，如何善用這些軌道交通來完成一場完美的自助旅行！
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